我国是世界上使用化肥、农药数量最大的国家之一。有关调查表明化肥的利用率低、流失率高，不仅导致农田土壤污染，还通过农田径流造成了对水体的有机污染、富营养化污染，甚至地下水污染和空气污染。 
　　一、化肥对环境的污染 
　　我国的化肥利用率平均只有30%～35%。每年有大量肥份流入水体，对环境产生了严重污染，对水体、土壤、大气、生物及人体健康造成严重危害。 
　　1.造成江河湖及地下水源的污染：农田径流带入地表水体的氮占人类活动排入水体氮的51%，这些江河湖　　水域中氨氮和硝酸盐都是主要污染物，富营养化日趋严重，同时造成地下水污染。 
　　2.威胁近海生物：大量氮肥流失为"赤潮生物"的迅猛增殖提供了丰富的氮营养条件，已成为赤潮的主要诱发因素之一。 
　　3.影响人类健康：人或牲畜食用大量含有硝酸盐的植物后，导致高铁血红素白血症，使人们出现行为反应障碍、工作能力下降、头晕目眩、意识丧失等症状，严重的还危及生命。饮用水、食物中硝酸盐超过一定含量，人食用后会受到很大毒害。 
　　4.破坏土壤结构：长期大量地使用氮肥特别是大量施用铵肥，使土壤逐渐酸化，板结普遍严重。一些地处热带的农田长期大量施用氮肥而不用有机肥，致使土壤严重板结，最终丧失了农业耕种价值。 
　　二、农药对环境的污染 
　　农药一旦进入环境，其毒性、高残留性便会发生反应，造成严重的大气、水体及土壤的污染。 
　　1.农药对大气的污染：农药微粒和蒸汽散发空中，随风飘移，污染全球。特别是滴滴涕，它除了化学稳定性和物理分散性外，滴滴涕还具有独特的流动性，它能随水汽共同蒸发到处流传，使整个生物圈都受到污染。 
　　2.农药对水体的污染：农药对水体的污染也是很普遍的。全世界生产了约150万吨滴滴涕，其中有100万吨左右仍残留在海水中。 
　　3.农药对土壤的污染：主要由于在其使用过程中，约有一半药剂下落在土壤中。由于农药本身不易被阳光和微生物分解，对酸和热稳定，不易挥发且难溶于水，故残留时间很长，尤以对粘土和于含有机质的土壤残留性更大。这些累积的农药还将在相当长的时间内发挥作用。 
　　三、化肥与农药对环境污染的防治 
　　1.化肥对环境污染的防治 
　　①科学施用钾肥。合理施用钾肥，要因地制宜，综合多种因素进行考虑并与氮、磷肥和微肥等进行配合施用。 
　　②科学施用磷肥。磷肥施入土壤后有两个特点：一是在土壤中移动性很小，其移动半径多在0.5～1厘米以内;二是容易被土壤中两价阳离子固定。这就造成作物根系吸收利用的困难，降低了肥效。 
　　③广泛施用有机肥。有机质是作物营养元素的主要来源，同时也是作物所需的各种微量元素的源泉。有机质是作物碳素营养的源泉，这主要靠土壤微生物分解有机质所产生的二氧化碳来满足作物生长的需求，另外它还能促进土壤有益微生物的活动。而且能形成土壤团粒结构，提高土壤保水、保肥和缓冲能力。 
　　④积极推广微生物肥料。土壤中的有机物质以及施用的厩肥、人粪尿和绿肥等，很多营养成分在未分解前作物是不能吸收利用的，也要通过微生物将它们分解，变成可溶性物质，才能被作物吸收利用。 
　　⑤积极推广垃圾堆肥。垃圾堆肥和垃圾复合肥的产生，既处理了城市垃圾，防止了污染，又生产出能够满足农业需要的高质量的有机肥料，具有积极的社会效益和经济效益。 
　　2.农药对环境污染的防治 
　　①防止农药污染的途径。采取综合防治的方法研究新的杀虫除害途径;搞好农药安全性评价和安全使用标准的制定工作;安全合理地使用现有农药;发展高效、低毒、低残留的农药。 
　　②现有农药的合理使用。首先必须调查研究各种病虫害的起因和发生的条件，做到能预测预报，对症下药。其次是混合和交替使用不同的农药，以防止产生抗药性并保护害虫的天敌;另外还要注意改进农药使用性能，改进农药在使用中的某些缺点。 
　　③加强生物防治并推广无公害的农药。 
利用害虫的天敌以虫治虫，是生物防治的一种行之有效的方法。这种方法经济简便，没有化学农药污染环境的缺点。寻找能分解长效性农药的土壤微生物，使大部分落在土壤内的农药很快被分解，这对免除环境污染极为有利。