自贡市农科所成立于1958年10月。截止2008年7月，全所职工108人，其中在职职工65人，在岗职工中科技人员42人，有研究员1人，高级农艺师14人，农艺师11名；辅助工人25人；省优专家1人，学术技术带头人2人，市拔尖人才3人；有硕士研究生1人，在读硕士研究生1人。离退休人员中研究员2人，副高级职称科技人员9人；享受国务院政府津贴专家1人，学术技术带头人2人。全所现设大豆研究室、水稻研究室（原名粮油研究室）、经济作物研究室、旱粮研究室（玉米研究室）4个研究室和办公室（包括人事科和财务室）、科技科、总务科（楠桂苑小区物业管理有限公司）3个服务机构。主要从事大豆、水稻、玉米、西瓜、蔬菜、油菜、花卉、甘薯等作物遗传育种及其栽培技术研究。 
　　1990年以来完成国家、省、市科研课题230项，获各级各类科技成果奖项43项。其中，获省政府科技进步三等奖4项，农业部丰收二等奖1项，省农业厅科技进步一等奖2项。育成农作物自主新品种19个，其中：大豆16个（国审2个），水稻、辣椒各1个。累计推广自主新品种、新技术、新产品面积达4500余万亩，产生社会经济效益40亿元以上，发表论文上百篇，为科技兴农作出了较大贡献。
　　大豆育种是我所科研的重点，自1982年开始大豆育种以来，我所共计自主育成并通过审定大豆新品种16个，对促进四川省及周边地区大豆生产的发展发挥了应有的作用。 1990年4月，大豆新品种贡豆1号、贡豆2号通过省审定，填补了我所无农作物审定品种的空白。1995年贡豆2号、1998年贡豆6号相继通过国家审定，填补了我所无国家审定大豆品种和农作物品种的空白。2000年，冬大豆新品种贡选1号通过四川省审定，填补了国内无套作专用审定品种的空白，并配套完成旱地“麦/玉+豆/苕”三熟四作模式及配套技术。
　　我所水稻栽培研究水平知名度高，至今仍处于国内领先水平。在杂交水稻简化育秧技术、高产、超高产栽培理论方面为促进水稻生产发展与科技进步作出了巨大贡献。尤其是紫泥田施锌防治水稻坐蔸、杂交稻中苗地膜小拱棚育秧技术、中稻区再生稻高产稳产栽培技术、四川盆地杂交中稻超高产栽培技术等至今仍在杂交水稻实用栽培技术中占据主导地位；1998年水稻工作重点转向杂交育种以来，第一个自主知识产权的水稻恢复系GR101于2005年通过四川省鉴定；杂交中稻新品种宜香101于2006年通过四川省农作物品种审定委员会审定，填补了自贡市、自贡市农业科学研究所无水稻审定品种的空白。目前已初步奠定了水稻杂交育种基础，被省农业厅正式立项支持。
　　我所自1986年开始西瓜引种研究，筛选出金龙、京欣1号、黄肉京欣、无籽西瓜系列、小果型口口脆系列等一批能代表当时西瓜品种水平，适应本地生态、气候、土壤条件的对路品种供生产使用，并配套完成育苗技术、整枝技术、嫁接技术和设施栽培技术。帮助我市西瓜年种植面积稳定在5.0万亩、产量2000公斤以上。
蔬菜常年引进20个以上品种，筛选出2个以上的品种供生产利用；所研究完成的秋豇豆、西瓜立体栽培技术，地膜覆盖、大棚温室、营养液、基质等设施栽培技术，反季节蔬菜，蔬菜嫁接技术等正在我市蔬菜生产上广泛应用。
　　从2001年底开始组织培养技术研究以来，组织培养脱毒快繁技术成功已在花卉和甘薯等块根块茎作物上应用。水稻花药培养的成功也将对我所育种产生很好地推动作用。
　　70年代开展了玉米育种和栽培研究，直到1998年停止。2002又重新开始玉米育种研究，现已提供自育组合参加省区试、预试和联试。玉米育种课题已列入省农业厅地市农科所科研计划。
　　2003年开展油菜育种以来，2007年秋季已提供1个自育品种参加省区试。油菜育种课题已基本步入正常序列。